De heilige Franciscus is dadelijk te herkennen aan de tekenen van zijn stigmatisatie - de kruiswonden in zijn zijde en zijn handen - en aan zijn armoedige en boetvaardige uiterlijk. Hij zit in extase te bidden terwijl voor hem op de rotsachtige grond een schedel een crucifix en een geseltwijg liggen. Ze symboliseren de onthechting van het aardse boete en contemplatie.